Người ta chế biến nước mắm hàu bằng cách cạy ruột hàu, rửa sạch, để cho ráo nước, sau đó trộn đều với muối, ớt bột, rượu cùng vài gia vị khác rồi cho vào chai, đậy kín nắp. Khoảng 20 ngày sau, chai mắm đổi màu, lúc phần thịt nổi lên trên còn phần nước lắng phía dưới có màu đỏ tươi. Người ta chiết ra lọc lấy nước đó chính là nước mắm hàu. Càng ủ lâu, nước mắm hàu dậy mùi thơm nồng và ăn càng ngon.
